作者：莫文娟[1,2]；李少锋[1*]；邱乾栋[3]；孙长忠[1]；汤志敏[1]；乔杰[2]；杜红岩[2]；傅建敏[2]

单位：[1]中国林业科学研究院华北林业实验中心；[2]中国林业科学研究院经济林研究开发中心；[3]北京林业大学生物科学与技术学院

期刊：林业科学研究，2016，29（3）：377-382

基金：十二五科技支撑“抗逆生态树种泡桐新品种选育技术研究”（2012BAD01B0602）；本研究部分实验在中国林业科学研究院重点开放实验室完成，在此感谢

摘要：【目的】通过测序法分析兰考泡桐与白花泡桐和毛泡桐在叶绿体rps16序列上的遗传差异，旨在分析三者之间在叶绿体基因上的变化特点和规律，探讨其种间的遗传关系。【方法】选取兰考泡桐、白花泡桐和毛泡桐各15个样本，对其提取的DNA用PCR扩增获得特异片段，并将其纯化与测序。利用软件Clustal X 2.0对所得序列进行排序；运行MEGA 4软件，进行多序列比对，分析其序列特征，并计算出K2P遗传距离。【结果】（1）对获得的rps16序列进行测定分析，得兰考泡桐序列长度分别为932 933 bp；白花泡桐序列长度为932 bp；毛泡桐序列长度分别为916918 bp。对所得rps16序列进行排序后的长度为938 bp，平均GC含量为34.31%。3个种所代表的个体之间共有10个变异位点，占整个序列长度的1.07%。其中有9个变异位点属于碱基插入或缺失类型，占变异位点总数的90%，占整个序列长度的0.96%。有1个变异位点属于碱基替换类型，占整个变异位点总数的10%，占整个序列长度的0.11%。（2）整个rps16片段的序列共有10个变异位点，其中兰考泡桐与白花泡桐在总的变异位点上，具有一致的碱基位点9个，占总变异的90%。而兰考泡桐与毛泡桐相比，没有相同的碱基。【结论】根据三种泡桐的rps16序列的序列特征和变异位点的分析，表明在叶绿体遗传方面，兰考泡桐具有与白花泡桐更多相似的遗传物质，其亲缘关系较近。综上所述，推测兰考泡桐与白花泡桐可能来自同一母系遗传。

关键词：兰考泡桐；白花泡桐；毛泡桐；rps16